Verkäufe über das Internet laufen in der Regel über einen Onlineshop. Mit einer Onlineshopsoftware lassen sich alle erforderlichen Prozesse für eCommerce effektiv organisieren. Neben der Verwaltung der eingehenden Webshop-Bestellungen über die Auslieferung der Produkte und Waren bis zur parallelen Online-Präsentation auf mehreren Verkaufsplattformen. Die Onlineshopsoftware kann auf Wunsch meist die Erstellung von Lieferscheinen und Rechnungen organisieren. Ebenso leistet Shopsoftware in Form einer eProcurement-Lösung im B2B-Umfeld die Direktbestellung oder Nachbestellung von Produkten beim Hersteller. Abhängig von der Art des Onlineshops und der Verkaufsplattform sind unterschiedliche Konfigurationen der Shop-Software erforderlich, weshalb eine professionelle eCommerce-Agentur zur Gestaltung, Einrichtung und fortlaufenden Optimierung der Onlineshopsoftware hinzugezogen werden sollte.